Protein–RNA interactions for Protein: A2A4M7

Gm11565, MCG1025733, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11565A2A4M7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm11565A2A4M7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm11565A2A4M7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm11565A2A4M7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm11565A2A4M7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm11565A2A4M7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm11565A2A4M7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm11565A2A4M7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gm11565A2A4M7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm11565A2A4M7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm11565A2A4M7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm11565A2A4M7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm11565A2A4M7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm11565A2A4M7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm11565A2A4M7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Gm11565A2A4M7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gm11565A2A4M7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gm11565A2A4M7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm11565A2A4M7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gm11565A2A4M7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm11565A2A4M7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gm11565A2A4M7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm11565A2A4M7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm11565A2A4M7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm11565A2A4M7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gm11565A2A4M7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm11565A2A4M7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm11565A2A4M7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm11565A2A4M7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm11565A2A4M7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm11565A2A4M7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm11565A2A4M7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm11565A2A4M7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11565A2A4M7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm11565A2A4M7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm11565A2A4M7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm11565A2A4M7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm11565A2A4M7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm11565A2A4M7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gm11565A2A4M7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm11565A2A4M7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm11565A2A4M7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm11565A2A4M7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm11565A2A4M7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gm11565A2A4M7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm11565A2A4M7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gm11565A2A4M7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gm11565A2A4M7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Gm11565A2A4M7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gm11565A2A4M7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm11565A2A4M7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gm11565A2A4M7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gm11565A2A4M7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gm11565A2A4M7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gm11565A2A4M7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm11565A2A4M7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gm11565A2A4M7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm11565A2A4M7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm11565A2A4M7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm11565A2A4M7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm11565A2A4M7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm11565A2A4M7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm11565A2A4M7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm11565A2A4M7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms