Protein–RNA interactions for Protein: A0A504

Smim17, MCG116182, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim17A0A504 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Smim17A0A504 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,65■■□□□ 1,54
Smim17A0A504 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Smim17A0A504 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
Smim17A0A504 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
Smim17A0A504 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Smim17A0A504 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24,57■■□□□ 1,52
Smim17A0A504 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Smim17A0A504 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Smim17A0A504 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Smim17A0A504 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Smim17A0A504 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24,44■■□□□ 1,5
Smim17A0A504 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Smim17A0A504 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Smim17A0A504 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,34■■□□□ 1,49
Smim17A0A504 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,34■■□□□ 1,49
Smim17A0A504 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
Smim17A0A504 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Smim17A0A504 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
Smim17A0A504 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Smim17A0A504 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Smim17A0A504 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,28■■□□□ 1,48
Smim17A0A504 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,23■■□□□ 1,47
Smim17A0A504 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
Smim17A0A504 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,18■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Smim17A0A504 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Smim17A0A504 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Smim17A0A504 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Smim17A0A504 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Smim17A0A504 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
Smim17A0A504 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Smim17A0A504 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Smim17A0A504 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Smim17A0A504 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,98■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,97■■□□□ 1,43
Smim17A0A504 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,94■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,91■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,9■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Smim17A0A504 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,87■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,86■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23,85■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,85■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
Smim17A0A504 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,81■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,77■■□□□ 1,4
Smim17A0A504 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,76■■□□□ 1,39
Smim17A0A504 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,75■■□□□ 1,39
Smim17A0A504 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Smim17A0A504 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Smim17A0A504 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,72■■□□□ 1,39
Smim17A0A504 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23,68■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,64■■□□□ 1,38
Smim17A0A504 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,64■■□□□ 1,37
Smim17A0A504 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,63■■□□□ 1,37
Smim17A0A504 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Smim17A0A504 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Smim17A0A504 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Smim17A0A504 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Smim17A0A504 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
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