Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY24

Ighv1-24, Immunoglobulin heavy variable V1-24 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,84■■□□□ 1,41
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,8■■□□□ 1,4
Ighv1-24A0A0A6YY24 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,78■■□□□ 1,4
Ighv1-24A0A0A6YY24 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,74■■□□□ 1,39
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,73■■□□□ 1,39
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,72■■□□□ 1,39
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23,7■■□□□ 1,38
Ighv1-24A0A0A6YY24 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Ighv1-24A0A0A6YY24 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Ighv1-24A0A0A6YY24 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv1-24A0A0A6YY24 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv1-24A0A0A6YY24 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,36
Ighv1-24A0A0A6YY24 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,57■■□□□ 1,36
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,54■■□□□ 1,36
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Ighv1-24A0A0A6YY24 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Ighv1-24A0A0A6YY24 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Ighv1-24A0A0A6YY24 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Ighv1-24A0A0A6YY24 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,2■■□□□ 1,3
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,19■■□□□ 1,3
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv1-24A0A0A6YY24 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Ighv1-24A0A0A6YY24 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv1-24A0A0A6YY24 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ighv1-24A0A0A6YY24 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Ighv1-24A0A0A6YY24 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,96■■□□□ 1,27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,94■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,93■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,89■■□□□ 1,26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Ighv1-24A0A0A6YY24 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,8■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,79■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-24A0A0A6YY24 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-24A0A0A6YY24 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv1-24A0A0A6YY24 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,69■■□□□ 1,22
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,68■■□□□ 1,22
Ighv1-24A0A0A6YY24 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv1-24A0A0A6YY24 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,62■■□□□ 1,21
Ighv1-24A0A0A6YY24 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,6■■□□□ 1,21
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22,6■■□□□ 1,21
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