Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YY24

Ighv1-24, Immunoglobulin heavy variable V1-24 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-24A0A0A6YY24 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ighv1-24A0A0A6YY24 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ighv1-24A0A0A6YY24 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ighv1-24A0A0A6YY24 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ighv1-24A0A0A6YY24 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Ighv1-24A0A0A6YY24 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ighv1-24A0A0A6YY24 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ighv1-24A0A0A6YY24 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ighv1-24A0A0A6YY24 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ighv1-24A0A0A6YY24 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ighv1-24A0A0A6YY24 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ighv1-24A0A0A6YY24 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ighv1-24A0A0A6YY24 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ighv1-24A0A0A6YY24 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ighv1-24A0A0A6YY24 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ighv1-24A0A0A6YY24 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ighv1-24A0A0A6YY24 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ighv1-24A0A0A6YY24 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ighv1-24A0A0A6YY24 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ighv1-24A0A0A6YY24 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ighv1-24A0A0A6YY24 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ighv1-24A0A0A6YY24 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ighv1-24A0A0A6YY24 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ighv1-24A0A0A6YY24 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ighv1-24A0A0A6YY24 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ighv1-24A0A0A6YY24 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ighv1-24A0A0A6YY24 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ighv1-24A0A0A6YY24 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ighv1-24A0A0A6YY24 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ighv1-24A0A0A6YY24 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ighv1-24A0A0A6YY24 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ighv1-24A0A0A6YY24 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ighv1-24A0A0A6YY24 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ighv1-24A0A0A6YY24 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv1-24A0A0A6YY24 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv1-24A0A0A6YY24 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ighv1-24A0A0A6YY24 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ighv1-24A0A0A6YY24 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ighv1-24A0A0A6YY24 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighv1-24A0A0A6YY24 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ighv1-24A0A0A6YY24 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ighv1-24A0A0A6YY24 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ighv1-24A0A0A6YY24 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ighv1-24A0A0A6YY24 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ighv1-24A0A0A6YY24 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ighv1-24A0A0A6YY24 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighv1-24A0A0A6YY24 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ighv1-24A0A0A6YY24 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ighv1-24A0A0A6YY24 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ighv1-24A0A0A6YY24 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv1-24A0A0A6YY24 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ighv1-24A0A0A6YY24 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
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