Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
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