Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXF1

Ighv3-4, Immunoglobulin heavy variable V3-4 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,61■■□□□ 1,37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,59■■□□□ 1,37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,58■■□□□ 1,37
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23,5■■□□□ 1,35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23,5■■□□□ 1,35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23,29■■□□□ 1,32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,18■■□□□ 1,3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,08■■□□□ 1,29
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23,06■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,04■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22,98■■□□□ 1,27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,88■■□□□ 1,25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22,85■■□□□ 1,25
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22,82■■□□□ 1,24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22,74■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,72■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,23
Ighv3-4A0A0A6YXF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22,67■■□□□ 1,22
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,63■■□□□ 1,21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,6■■□□□ 1,21
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22,57■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22,53■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,51■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22,48■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22,46■■□□□ 1,19
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22,44■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,18
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22,37■■□□□ 1,17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22,36■■□□□ 1,17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22,34■■□□□ 1,17
Ighv3-4A0A0A6YXF1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,33■■□□□ 1,17
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