Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF7Q9UBF6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF7Q9UBF6 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF7Q9UBF6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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RNF7Q9UBF6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
RNF7Q9UBF6 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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