Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CACNA2D2Q9NY47 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CACNA2D2Q9NY47 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms