Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCAPERQ9BY12 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCAPERQ9BY12 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms