Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGD4Q96M96 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGD4Q96M96 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms