Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLDN23Q96B33 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms