Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRUQ92729 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PTPRUQ92729 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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PTPRUQ92729 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PTPRUQ92729 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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