Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
DUX4L9Q6RFH8 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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