Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ANKRD40Q6AI12 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms