Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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LRRC38Q5VT99 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LRRC38Q5VT99 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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