Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CCDC153Q494R4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms