Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SYPL1Q16563 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SYPL1Q16563 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms