Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
AP3B2Q13367 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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AP3B2Q13367 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
AP3B2Q13367 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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