Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PRDM2Q13029 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PRDM2Q13029 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms