Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TROQ12816 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TROQ12816 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TROQ12816 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TROQ12816 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TROQ12816 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TROQ12816 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TROQ12816 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
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