Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms