Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CGNL1Q0VF96 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms