Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPN11Q06124 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPN11Q06124 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms