Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
XPCQ01831 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
XPCQ01831 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms