Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
COL6A2P12110 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
COL6A2P12110 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms