Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MAP3K4Q9Y6R4 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms