Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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RAB23Q9ULC3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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RAB23Q9ULC3 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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RAB23Q9ULC3 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
RAB23Q9ULC3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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