Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFT172Q9UG01 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IFT172Q9UG01 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms