Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPG2Q9UBF2 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms