Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHPF2Q9P2E5 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms