Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HCN3Q9P1Z3 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms