Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRR5

UBQLN4, Ubiquilin-4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN4Q9NRR5 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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UBQLN4Q9NRR5 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
UBQLN4Q9NRR5 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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