Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
GOPCQ9HD26 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GOPCQ9HD26 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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