Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F0

ASXL3, Putative Polycomb group protein ASXL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASXL3Q9C0F0 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ASXL3Q9C0F0 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms