Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TRIM54Q9BYV2 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms