Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTU6

PI4K2A, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4K2AQ9BTU6 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PI4K2AQ9BTU6 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms