Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RTKNQ9BST9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms