Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LRRIQ1Q96JM4 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
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