Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AVL9Q8NBF6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AVL9Q8NBF6 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms