Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CARMIL2Q6F5E8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms