Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
KLHL12Q53G59 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
KLHL12Q53G59 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms