Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CSRP2Q16527 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CSRP2Q16527 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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