Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SGCGQ13326 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms