Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SLAMF1Q13291 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms