Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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FOXF2Q12947 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
FOXF2Q12947 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
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