Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ARHGEF5Q12774 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARHGEF5Q12774 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
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