Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RASGEF1BQ0VAM2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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