Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GOLGA3Q08378 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms