Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 LGALS9C-215ENST00000584941 1104 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP7AQ04656 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms