Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CYP27A1Q02318 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms