Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GCLCP48506 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GCLCP48506 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms